Protein–RNA interactions for Protein: Q92560

BAP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BAP1Q92560 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BAP1Q92560 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BAP1Q92560 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BAP1Q92560 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BAP1Q92560 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BAP1Q92560 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BAP1Q92560 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BAP1Q92560 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
BAP1Q92560 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BAP1Q92560 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BAP1Q92560 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BAP1Q92560 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BAP1Q92560 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BAP1Q92560 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BAP1Q92560 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BAP1Q92560 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BAP1Q92560 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BAP1Q92560 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BAP1Q92560 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BAP1Q92560 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BAP1Q92560 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BAP1Q92560 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BAP1Q92560 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BAP1Q92560 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BAP1Q92560 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BAP1Q92560 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BAP1Q92560 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BAP1Q92560 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BAP1Q92560 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BAP1Q92560 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BAP1Q92560 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BAP1Q92560 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BAP1Q92560 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BAP1Q92560 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BAP1Q92560 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BAP1Q92560 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BAP1Q92560 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BAP1Q92560 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BAP1Q92560 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
BAP1Q92560 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BAP1Q92560 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BAP1Q92560 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BAP1Q92560 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BAP1Q92560 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BAP1Q92560 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BAP1Q92560 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BAP1Q92560 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BAP1Q92560 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BAP1Q92560 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BAP1Q92560 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BAP1Q92560 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BAP1Q92560 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BAP1Q92560 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BAP1Q92560 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BAP1Q92560 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
BAP1Q92560 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BAP1Q92560 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BAP1Q92560 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BAP1Q92560 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BAP1Q92560 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BAP1Q92560 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BAP1Q92560 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BAP1Q92560 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BAP1Q92560 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BAP1Q92560 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BAP1Q92560 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BAP1Q92560 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BAP1Q92560 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BAP1Q92560 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BAP1Q92560 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BAP1Q92560 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
BAP1Q92560 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BAP1Q92560 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
BAP1Q92560 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BAP1Q92560 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BAP1Q92560 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
BAP1Q92560 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BAP1Q92560 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BAP1Q92560 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BAP1Q92560 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BAP1Q92560 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.52■■■□□ 2
BAP1Q92560 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
BAP1Q92560 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BAP1Q92560 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.52■■■□□ 2
BAP1Q92560 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BAP1Q92560 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BAP1Q92560 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BAP1Q92560 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BAP1Q92560 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BAP1Q92560 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BAP1Q92560 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BAP1Q92560 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
BAP1Q92560 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
BAP1Q92560 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BAP1Q92560 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BAP1Q92560 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BAP1Q92560 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BAP1Q92560 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BAP1Q92560 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BAP1Q92560 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms