Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF62

ATP8B4, Probable phospholipid-transporting ATPase IM, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B4Q8TF62 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP8B4Q8TF62 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP8B4Q8TF62 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP8B4Q8TF62 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP8B4Q8TF62 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ATP8B4Q8TF62 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP8B4Q8TF62 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP8B4Q8TF62 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP8B4Q8TF62 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP8B4Q8TF62 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP8B4Q8TF62 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP8B4Q8TF62 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP8B4Q8TF62 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP8B4Q8TF62 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP8B4Q8TF62 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP8B4Q8TF62 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP8B4Q8TF62 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP8B4Q8TF62 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP8B4Q8TF62 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP8B4Q8TF62 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP8B4Q8TF62 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP8B4Q8TF62 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP8B4Q8TF62 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP8B4Q8TF62 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP8B4Q8TF62 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP8B4Q8TF62 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP8B4Q8TF62 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP8B4Q8TF62 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP8B4Q8TF62 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP8B4Q8TF62 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP8B4Q8TF62 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP8B4Q8TF62 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP8B4Q8TF62 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP8B4Q8TF62 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP8B4Q8TF62 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP8B4Q8TF62 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP8B4Q8TF62 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP8B4Q8TF62 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP8B4Q8TF62 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP8B4Q8TF62 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP8B4Q8TF62 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP8B4Q8TF62 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP8B4Q8TF62 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP8B4Q8TF62 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP8B4Q8TF62 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP8B4Q8TF62 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP8B4Q8TF62 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP8B4Q8TF62 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP8B4Q8TF62 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP8B4Q8TF62 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP8B4Q8TF62 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP8B4Q8TF62 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP8B4Q8TF62 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP8B4Q8TF62 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP8B4Q8TF62 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP8B4Q8TF62 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP8B4Q8TF62 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP8B4Q8TF62 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP8B4Q8TF62 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP8B4Q8TF62 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP8B4Q8TF62 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP8B4Q8TF62 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP8B4Q8TF62 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP8B4Q8TF62 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP8B4Q8TF62 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP8B4Q8TF62 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP8B4Q8TF62 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP8B4Q8TF62 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP8B4Q8TF62 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP8B4Q8TF62 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP8B4Q8TF62 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP8B4Q8TF62 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP8B4Q8TF62 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP8B4Q8TF62 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP8B4Q8TF62 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP8B4Q8TF62 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP8B4Q8TF62 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP8B4Q8TF62 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP8B4Q8TF62 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP8B4Q8TF62 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP8B4Q8TF62 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP8B4Q8TF62 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP8B4Q8TF62 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP8B4Q8TF62 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP8B4Q8TF62 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP8B4Q8TF62 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP8B4Q8TF62 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP8B4Q8TF62 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP8B4Q8TF62 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP8B4Q8TF62 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP8B4Q8TF62 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP8B4Q8TF62 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP8B4Q8TF62 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP8B4Q8TF62 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP8B4Q8TF62 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP8B4Q8TF62 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP8B4Q8TF62 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP8B4Q8TF62 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP8B4Q8TF62 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP8B4Q8TF62 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms