Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HAVCR2Q8TDQ0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HAVCR2Q8TDQ0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HAVCR2Q8TDQ0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HAVCR2Q8TDQ0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HAVCR2Q8TDQ0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HAVCR2Q8TDQ0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
HAVCR2Q8TDQ0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HAVCR2Q8TDQ0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HAVCR2Q8TDQ0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HAVCR2Q8TDQ0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HAVCR2Q8TDQ0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HAVCR2Q8TDQ0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HAVCR2Q8TDQ0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HAVCR2Q8TDQ0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HAVCR2Q8TDQ0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HAVCR2Q8TDQ0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HAVCR2Q8TDQ0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HAVCR2Q8TDQ0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HAVCR2Q8TDQ0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HAVCR2Q8TDQ0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HAVCR2Q8TDQ0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HAVCR2Q8TDQ0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HAVCR2Q8TDQ0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HAVCR2Q8TDQ0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HAVCR2Q8TDQ0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HAVCR2Q8TDQ0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HAVCR2Q8TDQ0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HAVCR2Q8TDQ0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HAVCR2Q8TDQ0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HAVCR2Q8TDQ0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HAVCR2Q8TDQ0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HAVCR2Q8TDQ0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HAVCR2Q8TDQ0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HAVCR2Q8TDQ0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HAVCR2Q8TDQ0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HAVCR2Q8TDQ0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HAVCR2Q8TDQ0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HAVCR2Q8TDQ0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HAVCR2Q8TDQ0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HAVCR2Q8TDQ0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HAVCR2Q8TDQ0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HAVCR2Q8TDQ0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HAVCR2Q8TDQ0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HAVCR2Q8TDQ0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HAVCR2Q8TDQ0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HAVCR2Q8TDQ0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HAVCR2Q8TDQ0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HAVCR2Q8TDQ0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HAVCR2Q8TDQ0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HAVCR2Q8TDQ0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HAVCR2Q8TDQ0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HAVCR2Q8TDQ0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HAVCR2Q8TDQ0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HAVCR2Q8TDQ0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HAVCR2Q8TDQ0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HAVCR2Q8TDQ0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HAVCR2Q8TDQ0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HAVCR2Q8TDQ0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HAVCR2Q8TDQ0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HAVCR2Q8TDQ0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HAVCR2Q8TDQ0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HAVCR2Q8TDQ0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HAVCR2Q8TDQ0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HAVCR2Q8TDQ0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HAVCR2Q8TDQ0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HAVCR2Q8TDQ0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HAVCR2Q8TDQ0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HAVCR2Q8TDQ0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HAVCR2Q8TDQ0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HAVCR2Q8TDQ0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HAVCR2Q8TDQ0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HAVCR2Q8TDQ0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HAVCR2Q8TDQ0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HAVCR2Q8TDQ0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HAVCR2Q8TDQ0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HAVCR2Q8TDQ0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HAVCR2Q8TDQ0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HAVCR2Q8TDQ0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HAVCR2Q8TDQ0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HAVCR2Q8TDQ0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HAVCR2Q8TDQ0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HAVCR2Q8TDQ0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HAVCR2Q8TDQ0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HAVCR2Q8TDQ0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HAVCR2Q8TDQ0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HAVCR2Q8TDQ0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HAVCR2Q8TDQ0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HAVCR2Q8TDQ0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HAVCR2Q8TDQ0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HAVCR2Q8TDQ0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HAVCR2Q8TDQ0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HAVCR2Q8TDQ0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HAVCR2Q8TDQ0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HAVCR2Q8TDQ0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HAVCR2Q8TDQ0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HAVCR2Q8TDQ0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HAVCR2Q8TDQ0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms