Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFD4

Uncharacterized protein FLJ76381, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8NFD4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q8NFD4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q8NFD4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q8NFD4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q8NFD4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q8NFD4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q8NFD4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q8NFD4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q8NFD4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q8NFD4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q8NFD4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Q8NFD4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q8NFD4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q8NFD4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q8NFD4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q8NFD4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q8NFD4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q8NFD4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8NFD4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8NFD4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8NFD4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8NFD4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8NFD4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Q8NFD4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q8NFD4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Q8NFD4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q8NFD4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q8NFD4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q8NFD4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q8NFD4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q8NFD4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q8NFD4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q8NFD4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q8NFD4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q8NFD4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q8NFD4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Q8NFD4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Q8NFD4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q8NFD4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q8NFD4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q8NFD4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q8NFD4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q8NFD4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q8NFD4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Q8NFD4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q8NFD4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q8NFD4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q8NFD4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q8NFD4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8NFD4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q8NFD4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q8NFD4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Q8NFD4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q8NFD4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q8NFD4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q8NFD4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q8NFD4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q8NFD4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8NFD4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8NFD4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8NFD4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8NFD4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8NFD4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8NFD4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8NFD4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8NFD4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8NFD4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8NFD4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8NFD4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8NFD4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8NFD4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8NFD4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8NFD4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8NFD4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8NFD4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8NFD4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8NFD4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8NFD4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8NFD4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8NFD4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8NFD4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8NFD4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8NFD4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q8NFD4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q8NFD4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8NFD4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8NFD4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8NFD4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8NFD4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8NFD4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8NFD4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8NFD4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8NFD4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8NFD4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8NFD4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8NFD4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8NFD4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8NFD4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8NFD4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8NFD4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms