Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI8

CRLF3, Cytokine receptor-like factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLF3Q8IUI8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRLF3Q8IUI8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRLF3Q8IUI8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRLF3Q8IUI8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRLF3Q8IUI8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRLF3Q8IUI8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRLF3Q8IUI8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRLF3Q8IUI8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRLF3Q8IUI8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRLF3Q8IUI8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRLF3Q8IUI8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRLF3Q8IUI8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRLF3Q8IUI8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRLF3Q8IUI8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRLF3Q8IUI8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRLF3Q8IUI8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRLF3Q8IUI8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRLF3Q8IUI8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRLF3Q8IUI8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRLF3Q8IUI8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRLF3Q8IUI8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRLF3Q8IUI8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRLF3Q8IUI8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CRLF3Q8IUI8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRLF3Q8IUI8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRLF3Q8IUI8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRLF3Q8IUI8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRLF3Q8IUI8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRLF3Q8IUI8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRLF3Q8IUI8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CRLF3Q8IUI8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CRLF3Q8IUI8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRLF3Q8IUI8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRLF3Q8IUI8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRLF3Q8IUI8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRLF3Q8IUI8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRLF3Q8IUI8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRLF3Q8IUI8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRLF3Q8IUI8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRLF3Q8IUI8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRLF3Q8IUI8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRLF3Q8IUI8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRLF3Q8IUI8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRLF3Q8IUI8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRLF3Q8IUI8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRLF3Q8IUI8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRLF3Q8IUI8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRLF3Q8IUI8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CRLF3Q8IUI8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRLF3Q8IUI8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRLF3Q8IUI8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRLF3Q8IUI8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRLF3Q8IUI8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRLF3Q8IUI8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRLF3Q8IUI8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRLF3Q8IUI8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRLF3Q8IUI8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRLF3Q8IUI8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRLF3Q8IUI8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRLF3Q8IUI8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRLF3Q8IUI8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRLF3Q8IUI8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRLF3Q8IUI8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRLF3Q8IUI8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRLF3Q8IUI8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRLF3Q8IUI8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRLF3Q8IUI8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRLF3Q8IUI8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRLF3Q8IUI8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRLF3Q8IUI8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms