Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LCA5Q86VQ0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LCA5Q86VQ0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LCA5Q86VQ0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LCA5Q86VQ0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LCA5Q86VQ0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LCA5Q86VQ0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCA5Q86VQ0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCA5Q86VQ0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCA5Q86VQ0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCA5Q86VQ0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LCA5Q86VQ0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LCA5Q86VQ0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LCA5Q86VQ0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LCA5Q86VQ0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LCA5Q86VQ0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LCA5Q86VQ0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCA5Q86VQ0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCA5Q86VQ0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCA5Q86VQ0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCA5Q86VQ0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCA5Q86VQ0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCA5Q86VQ0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCA5Q86VQ0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LCA5Q86VQ0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCA5Q86VQ0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCA5Q86VQ0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCA5Q86VQ0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LCA5Q86VQ0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCA5Q86VQ0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCA5Q86VQ0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCA5Q86VQ0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCA5Q86VQ0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCA5Q86VQ0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCA5Q86VQ0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCA5Q86VQ0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCA5Q86VQ0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCA5Q86VQ0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCA5Q86VQ0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCA5Q86VQ0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCA5Q86VQ0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCA5Q86VQ0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCA5Q86VQ0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCA5Q86VQ0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCA5Q86VQ0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCA5Q86VQ0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LCA5Q86VQ0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCA5Q86VQ0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCA5Q86VQ0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCA5Q86VQ0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCA5Q86VQ0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCA5Q86VQ0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCA5Q86VQ0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCA5Q86VQ0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCA5Q86VQ0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCA5Q86VQ0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCA5Q86VQ0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCA5Q86VQ0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCA5Q86VQ0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCA5Q86VQ0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCA5Q86VQ0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCA5Q86VQ0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LCA5Q86VQ0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCA5Q86VQ0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LCA5Q86VQ0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCA5Q86VQ0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCA5Q86VQ0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCA5Q86VQ0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCA5Q86VQ0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCA5Q86VQ0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCA5Q86VQ0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCA5Q86VQ0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCA5Q86VQ0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCA5Q86VQ0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCA5Q86VQ0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCA5Q86VQ0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCA5Q86VQ0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCA5Q86VQ0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCA5Q86VQ0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCA5Q86VQ0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCA5Q86VQ0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCA5Q86VQ0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCA5Q86VQ0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LCA5Q86VQ0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCA5Q86VQ0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCA5Q86VQ0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCA5Q86VQ0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCA5Q86VQ0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCA5Q86VQ0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCA5Q86VQ0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCA5Q86VQ0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCA5Q86VQ0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCA5Q86VQ0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCA5Q86VQ0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCA5Q86VQ0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCA5Q86VQ0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCA5Q86VQ0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCA5Q86VQ0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCA5Q86VQ0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCA5Q86VQ0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms