Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFPL4BQ6ZWI9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFPL4BQ6ZWI9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFPL4BQ6ZWI9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFPL4BQ6ZWI9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFPL4BQ6ZWI9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFPL4BQ6ZWI9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFPL4BQ6ZWI9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFPL4BQ6ZWI9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFPL4BQ6ZWI9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFPL4BQ6ZWI9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFPL4BQ6ZWI9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFPL4BQ6ZWI9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFPL4BQ6ZWI9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFPL4BQ6ZWI9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFPL4BQ6ZWI9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFPL4BQ6ZWI9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFPL4BQ6ZWI9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFPL4BQ6ZWI9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFPL4BQ6ZWI9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFPL4BQ6ZWI9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFPL4BQ6ZWI9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFPL4BQ6ZWI9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFPL4BQ6ZWI9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFPL4BQ6ZWI9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFPL4BQ6ZWI9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RFPL4BQ6ZWI9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL4BQ6ZWI9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL4BQ6ZWI9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL4BQ6ZWI9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL4BQ6ZWI9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL4BQ6ZWI9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL4BQ6ZWI9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFPL4BQ6ZWI9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL4BQ6ZWI9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL4BQ6ZWI9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL4BQ6ZWI9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL4BQ6ZWI9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL4BQ6ZWI9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL4BQ6ZWI9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL4BQ6ZWI9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFPL4BQ6ZWI9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFPL4BQ6ZWI9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFPL4BQ6ZWI9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFPL4BQ6ZWI9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFPL4BQ6ZWI9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RFPL4BQ6ZWI9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFPL4BQ6ZWI9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.3 ms