Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTQ4

CDHR3, Cadherin-related family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3Q6ZTQ4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDHR3Q6ZTQ4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDHR3Q6ZTQ4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDHR3Q6ZTQ4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDHR3Q6ZTQ4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDHR3Q6ZTQ4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDHR3Q6ZTQ4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDHR3Q6ZTQ4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDHR3Q6ZTQ4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDHR3Q6ZTQ4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDHR3Q6ZTQ4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDHR3Q6ZTQ4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDHR3Q6ZTQ4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDHR3Q6ZTQ4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDHR3Q6ZTQ4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDHR3Q6ZTQ4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDHR3Q6ZTQ4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDHR3Q6ZTQ4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDHR3Q6ZTQ4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDHR3Q6ZTQ4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDHR3Q6ZTQ4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDHR3Q6ZTQ4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDHR3Q6ZTQ4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDHR3Q6ZTQ4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDHR3Q6ZTQ4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDHR3Q6ZTQ4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDHR3Q6ZTQ4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDHR3Q6ZTQ4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDHR3Q6ZTQ4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDHR3Q6ZTQ4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDHR3Q6ZTQ4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDHR3Q6ZTQ4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDHR3Q6ZTQ4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDHR3Q6ZTQ4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CDHR3Q6ZTQ4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDHR3Q6ZTQ4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDHR3Q6ZTQ4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDHR3Q6ZTQ4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDHR3Q6ZTQ4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDHR3Q6ZTQ4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDHR3Q6ZTQ4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDHR3Q6ZTQ4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDHR3Q6ZTQ4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDHR3Q6ZTQ4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDHR3Q6ZTQ4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDHR3Q6ZTQ4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDHR3Q6ZTQ4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDHR3Q6ZTQ4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDHR3Q6ZTQ4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDHR3Q6ZTQ4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDHR3Q6ZTQ4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDHR3Q6ZTQ4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDHR3Q6ZTQ4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDHR3Q6ZTQ4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDHR3Q6ZTQ4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR3Q6ZTQ4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR3Q6ZTQ4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR3Q6ZTQ4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR3Q6ZTQ4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDHR3Q6ZTQ4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDHR3Q6ZTQ4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDHR3Q6ZTQ4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDHR3Q6ZTQ4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDHR3Q6ZTQ4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDHR3Q6ZTQ4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDHR3Q6ZTQ4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDHR3Q6ZTQ4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDHR3Q6ZTQ4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDHR3Q6ZTQ4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms