Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASCL4Q6XD76 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ASCL4Q6XD76 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ASCL4Q6XD76 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ASCL4Q6XD76 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ASCL4Q6XD76 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ASCL4Q6XD76 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASCL4Q6XD76 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASCL4Q6XD76 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASCL4Q6XD76 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASCL4Q6XD76 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ASCL4Q6XD76 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ASCL4Q6XD76 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ASCL4Q6XD76 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ASCL4Q6XD76 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ASCL4Q6XD76 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASCL4Q6XD76 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASCL4Q6XD76 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASCL4Q6XD76 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASCL4Q6XD76 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASCL4Q6XD76 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASCL4Q6XD76 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASCL4Q6XD76 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASCL4Q6XD76 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASCL4Q6XD76 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASCL4Q6XD76 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASCL4Q6XD76 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASCL4Q6XD76 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASCL4Q6XD76 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASCL4Q6XD76 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASCL4Q6XD76 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASCL4Q6XD76 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ASCL4Q6XD76 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASCL4Q6XD76 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASCL4Q6XD76 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ASCL4Q6XD76 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASCL4Q6XD76 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASCL4Q6XD76 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASCL4Q6XD76 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASCL4Q6XD76 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASCL4Q6XD76 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASCL4Q6XD76 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASCL4Q6XD76 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASCL4Q6XD76 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ASCL4Q6XD76 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ASCL4Q6XD76 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASCL4Q6XD76 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASCL4Q6XD76 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASCL4Q6XD76 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASCL4Q6XD76 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASCL4Q6XD76 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASCL4Q6XD76 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASCL4Q6XD76 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASCL4Q6XD76 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASCL4Q6XD76 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASCL4Q6XD76 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ASCL4Q6XD76 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASCL4Q6XD76 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASCL4Q6XD76 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASCL4Q6XD76 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASCL4Q6XD76 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASCL4Q6XD76 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASCL4Q6XD76 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASCL4Q6XD76 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASCL4Q6XD76 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ASCL4Q6XD76 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASCL4Q6XD76 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASCL4Q6XD76 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASCL4Q6XD76 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASCL4Q6XD76 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms