Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRSAM1Q6UWE0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRSAM1Q6UWE0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRSAM1Q6UWE0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRSAM1Q6UWE0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRSAM1Q6UWE0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LRSAM1Q6UWE0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRSAM1Q6UWE0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRSAM1Q6UWE0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRSAM1Q6UWE0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRSAM1Q6UWE0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRSAM1Q6UWE0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRSAM1Q6UWE0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRSAM1Q6UWE0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRSAM1Q6UWE0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRSAM1Q6UWE0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRSAM1Q6UWE0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LRSAM1Q6UWE0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRSAM1Q6UWE0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRSAM1Q6UWE0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRSAM1Q6UWE0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRSAM1Q6UWE0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRSAM1Q6UWE0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRSAM1Q6UWE0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRSAM1Q6UWE0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRSAM1Q6UWE0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRSAM1Q6UWE0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRSAM1Q6UWE0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRSAM1Q6UWE0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRSAM1Q6UWE0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRSAM1Q6UWE0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRSAM1Q6UWE0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRSAM1Q6UWE0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRSAM1Q6UWE0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRSAM1Q6UWE0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRSAM1Q6UWE0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRSAM1Q6UWE0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRSAM1Q6UWE0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRSAM1Q6UWE0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRSAM1Q6UWE0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRSAM1Q6UWE0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRSAM1Q6UWE0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRSAM1Q6UWE0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRSAM1Q6UWE0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRSAM1Q6UWE0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRSAM1Q6UWE0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRSAM1Q6UWE0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRSAM1Q6UWE0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRSAM1Q6UWE0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LRSAM1Q6UWE0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRSAM1Q6UWE0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRSAM1Q6UWE0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRSAM1Q6UWE0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRSAM1Q6UWE0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRSAM1Q6UWE0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LRSAM1Q6UWE0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRSAM1Q6UWE0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRSAM1Q6UWE0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRSAM1Q6UWE0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRSAM1Q6UWE0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRSAM1Q6UWE0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRSAM1Q6UWE0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRSAM1Q6UWE0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LRSAM1Q6UWE0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LRSAM1Q6UWE0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRSAM1Q6UWE0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRSAM1Q6UWE0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRSAM1Q6UWE0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRSAM1Q6UWE0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRSAM1Q6UWE0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRSAM1Q6UWE0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRSAM1Q6UWE0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRSAM1Q6UWE0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRSAM1Q6UWE0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRSAM1Q6UWE0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRSAM1Q6UWE0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LRSAM1Q6UWE0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRSAM1Q6UWE0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRSAM1Q6UWE0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRSAM1Q6UWE0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRSAM1Q6UWE0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRSAM1Q6UWE0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRSAM1Q6UWE0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRSAM1Q6UWE0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRSAM1Q6UWE0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRSAM1Q6UWE0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRSAM1Q6UWE0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRSAM1Q6UWE0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRSAM1Q6UWE0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRSAM1Q6UWE0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRSAM1Q6UWE0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRSAM1Q6UWE0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRSAM1Q6UWE0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRSAM1Q6UWE0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRSAM1Q6UWE0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRSAM1Q6UWE0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRSAM1Q6UWE0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRSAM1Q6UWE0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRSAM1Q6UWE0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
LRSAM1Q6UWE0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms