Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB28

METAP1D, Methionine aminopeptidase 1D, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
METAP1DQ6UB28 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
METAP1DQ6UB28 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
METAP1DQ6UB28 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
METAP1DQ6UB28 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
METAP1DQ6UB28 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
METAP1DQ6UB28 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
METAP1DQ6UB28 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
METAP1DQ6UB28 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
METAP1DQ6UB28 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
METAP1DQ6UB28 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
METAP1DQ6UB28 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
METAP1DQ6UB28 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
METAP1DQ6UB28 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
METAP1DQ6UB28 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
METAP1DQ6UB28 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
METAP1DQ6UB28 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
METAP1DQ6UB28 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
METAP1DQ6UB28 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
METAP1DQ6UB28 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
METAP1DQ6UB28 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
METAP1DQ6UB28 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
METAP1DQ6UB28 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
METAP1DQ6UB28 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
METAP1DQ6UB28 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
METAP1DQ6UB28 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
METAP1DQ6UB28 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
METAP1DQ6UB28 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
METAP1DQ6UB28 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
METAP1DQ6UB28 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
METAP1DQ6UB28 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
METAP1DQ6UB28 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
METAP1DQ6UB28 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
METAP1DQ6UB28 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
METAP1DQ6UB28 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
METAP1DQ6UB28 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
METAP1DQ6UB28 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
METAP1DQ6UB28 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
METAP1DQ6UB28 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
METAP1DQ6UB28 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
METAP1DQ6UB28 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
METAP1DQ6UB28 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
METAP1DQ6UB28 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms