Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC70Q6NSX1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC70Q6NSX1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC70Q6NSX1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC70Q6NSX1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC70Q6NSX1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC70Q6NSX1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC70Q6NSX1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC70Q6NSX1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC70Q6NSX1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC70Q6NSX1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC70Q6NSX1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC70Q6NSX1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC70Q6NSX1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC70Q6NSX1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC70Q6NSX1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC70Q6NSX1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC70Q6NSX1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC70Q6NSX1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC70Q6NSX1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC70Q6NSX1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC70Q6NSX1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC70Q6NSX1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC70Q6NSX1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC70Q6NSX1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC70Q6NSX1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC70Q6NSX1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC70Q6NSX1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC70Q6NSX1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC70Q6NSX1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC70Q6NSX1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC70Q6NSX1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC70Q6NSX1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC70Q6NSX1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC70Q6NSX1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC70Q6NSX1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC70Q6NSX1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC70Q6NSX1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC70Q6NSX1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC70Q6NSX1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC70Q6NSX1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC70Q6NSX1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC70Q6NSX1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC70Q6NSX1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC70Q6NSX1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC70Q6NSX1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC70Q6NSX1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC70Q6NSX1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC70Q6NSX1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC70Q6NSX1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC70Q6NSX1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC70Q6NSX1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC70Q6NSX1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC70Q6NSX1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC70Q6NSX1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC70Q6NSX1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms