Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
CCDC70Q6NSX1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC70Q6NSX1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CCDC70Q6NSX1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CCDC70Q6NSX1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC70Q6NSX1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC70Q6NSX1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC70Q6NSX1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC70Q6NSX1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC70Q6NSX1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC70Q6NSX1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC70Q6NSX1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC70Q6NSX1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC70Q6NSX1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC70Q6NSX1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC70Q6NSX1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC70Q6NSX1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC70Q6NSX1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC70Q6NSX1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC70Q6NSX1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC70Q6NSX1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC70Q6NSX1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC70Q6NSX1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC70Q6NSX1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC70Q6NSX1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC70Q6NSX1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC70Q6NSX1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC70Q6NSX1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC70Q6NSX1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC70Q6NSX1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC70Q6NSX1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC70Q6NSX1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC70Q6NSX1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC70Q6NSX1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC70Q6NSX1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC70Q6NSX1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC70Q6NSX1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC70Q6NSX1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC70Q6NSX1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CCDC70Q6NSX1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CCDC70Q6NSX1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CCDC70Q6NSX1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC70Q6NSX1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC70Q6NSX1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC70Q6NSX1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC70Q6NSX1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC70Q6NSX1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC70Q6NSX1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC70Q6NSX1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC70Q6NSX1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC70Q6NSX1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC70Q6NSX1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC70Q6NSX1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC70Q6NSX1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC70Q6NSX1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC70Q6NSX1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC70Q6NSX1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC70Q6NSX1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC70Q6NSX1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC70Q6NSX1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC70Q6NSX1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC70Q6NSX1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC70Q6NSX1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC70Q6NSX1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC70Q6NSX1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC70Q6NSX1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC70Q6NSX1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC70Q6NSX1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC70Q6NSX1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC70Q6NSX1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC70Q6NSX1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC70Q6NSX1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC70Q6NSX1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC70Q6NSX1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CCDC70Q6NSX1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC70Q6NSX1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC70Q6NSX1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC70Q6NSX1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC70Q6NSX1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC70Q6NSX1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC70Q6NSX1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC70Q6NSX1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC70Q6NSX1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC70Q6NSX1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC70Q6NSX1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC70Q6NSX1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC70Q6NSX1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CCDC70Q6NSX1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC70Q6NSX1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC70Q6NSX1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC70Q6NSX1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC70Q6NSX1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC70Q6NSX1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC70Q6NSX1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC70Q6NSX1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC70Q6NSX1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC70Q6NSX1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC70Q6NSX1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC70Q6NSX1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
CCDC70Q6NSX1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms