Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
BEND3Q5T5X7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
BEND3Q5T5X7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
BEND3Q5T5X7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
BEND3Q5T5X7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
BEND3Q5T5X7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.81
BEND3Q5T5X7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
BEND3Q5T5X7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
BEND3Q5T5X7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
BEND3Q5T5X7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
BEND3Q5T5X7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
BEND3Q5T5X7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
BEND3Q5T5X7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
BEND3Q5T5X7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
BEND3Q5T5X7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
BEND3Q5T5X7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
BEND3Q5T5X7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
BEND3Q5T5X7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
BEND3Q5T5X7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
BEND3Q5T5X7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
BEND3Q5T5X7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
BEND3Q5T5X7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
BEND3Q5T5X7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
BEND3Q5T5X7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
BEND3Q5T5X7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
BEND3Q5T5X7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
BEND3Q5T5X7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
BEND3Q5T5X7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
BEND3Q5T5X7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
BEND3Q5T5X7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
BEND3Q5T5X7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
BEND3Q5T5X7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BEND3Q5T5X7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
BEND3Q5T5X7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
BEND3Q5T5X7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
BEND3Q5T5X7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
BEND3Q5T5X7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
BEND3Q5T5X7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
BEND3Q5T5X7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
BEND3Q5T5X7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
BEND3Q5T5X7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
BEND3Q5T5X7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
BEND3Q5T5X7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
BEND3Q5T5X7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
BEND3Q5T5X7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
BEND3Q5T5X7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
BEND3Q5T5X7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
BEND3Q5T5X7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
BEND3Q5T5X7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
BEND3Q5T5X7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
BEND3Q5T5X7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
BEND3Q5T5X7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
BEND3Q5T5X7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
BEND3Q5T5X7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
BEND3Q5T5X7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
BEND3Q5T5X7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
BEND3Q5T5X7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
BEND3Q5T5X7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
BEND3Q5T5X7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
BEND3Q5T5X7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
BEND3Q5T5X7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
BEND3Q5T5X7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
BEND3Q5T5X7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
BEND3Q5T5X7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
BEND3Q5T5X7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
BEND3Q5T5X7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
BEND3Q5T5X7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
BEND3Q5T5X7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
BEND3Q5T5X7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
BEND3Q5T5X7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
BEND3Q5T5X7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
BEND3Q5T5X7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
BEND3Q5T5X7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BEND3Q5T5X7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BEND3Q5T5X7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
BEND3Q5T5X7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BEND3Q5T5X7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
BEND3Q5T5X7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BEND3Q5T5X7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BEND3Q5T5X7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
BEND3Q5T5X7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
BEND3Q5T5X7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
BEND3Q5T5X7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
BEND3Q5T5X7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
BEND3Q5T5X7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
BEND3Q5T5X7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
BEND3Q5T5X7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
BEND3Q5T5X7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
BEND3Q5T5X7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
BEND3Q5T5X7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
BEND3Q5T5X7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
BEND3Q5T5X7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
BEND3Q5T5X7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
BEND3Q5T5X7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
BEND3Q5T5X7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
BEND3Q5T5X7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
BEND3Q5T5X7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
BEND3Q5T5X7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
BEND3Q5T5X7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
BEND3Q5T5X7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms