Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COBLL1Q53SF7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COBLL1Q53SF7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COBLL1Q53SF7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COBLL1Q53SF7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
COBLL1Q53SF7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COBLL1Q53SF7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COBLL1Q53SF7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COBLL1Q53SF7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
COBLL1Q53SF7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COBLL1Q53SF7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COBLL1Q53SF7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COBLL1Q53SF7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COBLL1Q53SF7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COBLL1Q53SF7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COBLL1Q53SF7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COBLL1Q53SF7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COBLL1Q53SF7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COBLL1Q53SF7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COBLL1Q53SF7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COBLL1Q53SF7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COBLL1Q53SF7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COBLL1Q53SF7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COBLL1Q53SF7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COBLL1Q53SF7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COBLL1Q53SF7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COBLL1Q53SF7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
COBLL1Q53SF7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COBLL1Q53SF7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
COBLL1Q53SF7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
COBLL1Q53SF7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
COBLL1Q53SF7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
COBLL1Q53SF7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
COBLL1Q53SF7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COBLL1Q53SF7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COBLL1Q53SF7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
COBLL1Q53SF7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
COBLL1Q53SF7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COBLL1Q53SF7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COBLL1Q53SF7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COBLL1Q53SF7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COBLL1Q53SF7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COBLL1Q53SF7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COBLL1Q53SF7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COBLL1Q53SF7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COBLL1Q53SF7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COBLL1Q53SF7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COBLL1Q53SF7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COBLL1Q53SF7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COBLL1Q53SF7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COBLL1Q53SF7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COBLL1Q53SF7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
COBLL1Q53SF7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COBLL1Q53SF7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COBLL1Q53SF7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COBLL1Q53SF7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COBLL1Q53SF7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COBLL1Q53SF7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COBLL1Q53SF7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
COBLL1Q53SF7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
COBLL1Q53SF7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COBLL1Q53SF7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COBLL1Q53SF7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COBLL1Q53SF7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COBLL1Q53SF7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COBLL1Q53SF7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COBLL1Q53SF7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COBLL1Q53SF7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COBLL1Q53SF7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms