Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPAQ15257 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPAQ15257 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPAQ15257 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPAQ15257 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPAQ15257 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPAQ15257 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPAQ15257 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPAQ15257 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPAQ15257 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPAQ15257 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPAQ15257 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PTPAQ15257 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPAQ15257 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPAQ15257 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPAQ15257 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPAQ15257 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPAQ15257 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPAQ15257 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPAQ15257 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPAQ15257 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPAQ15257 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPAQ15257 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPAQ15257 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPAQ15257 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPAQ15257 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPAQ15257 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPAQ15257 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPAQ15257 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPAQ15257 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPAQ15257 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPAQ15257 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPAQ15257 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPAQ15257 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPAQ15257 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPAQ15257 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPAQ15257 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPAQ15257 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPAQ15257 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPAQ15257 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPAQ15257 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPAQ15257 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPAQ15257 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPAQ15257 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPAQ15257 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPAQ15257 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPAQ15257 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPAQ15257 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPAQ15257 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPAQ15257 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPAQ15257 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPAQ15257 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPAQ15257 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPAQ15257 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPAQ15257 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPAQ15257 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPAQ15257 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPAQ15257 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPAQ15257 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPAQ15257 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPAQ15257 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPAQ15257 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPAQ15257 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPAQ15257 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPAQ15257 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPAQ15257 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPAQ15257 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPAQ15257 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPAQ15257 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPAQ15257 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPAQ15257 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPAQ15257 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPAQ15257 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPAQ15257 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPAQ15257 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPAQ15257 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPAQ15257 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPAQ15257 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPAQ15257 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPAQ15257 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPAQ15257 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPAQ15257 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPAQ15257 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPAQ15257 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPAQ15257 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPAQ15257 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPAQ15257 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPAQ15257 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPAQ15257 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPAQ15257 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPAQ15257 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPAQ15257 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPAQ15257 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPAQ15257 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPAQ15257 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPAQ15257 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPAQ15257 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPAQ15257 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPAQ15257 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPAQ15257 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
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