Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PTPAQ15257 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
PTPAQ15257 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
PTPAQ15257 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PTPAQ15257 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PTPAQ15257 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PTPAQ15257 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PTPAQ15257 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PTPAQ15257 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPAQ15257 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPAQ15257 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PTPAQ15257 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PTPAQ15257 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTPAQ15257 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PTPAQ15257 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PTPAQ15257 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPAQ15257 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PTPAQ15257 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PTPAQ15257 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPAQ15257 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PTPAQ15257 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PTPAQ15257 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPAQ15257 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PTPAQ15257 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PTPAQ15257 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PTPAQ15257 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PTPAQ15257 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PTPAQ15257 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PTPAQ15257 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTPAQ15257 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PTPAQ15257 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PTPAQ15257 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PTPAQ15257 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPAQ15257 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPAQ15257 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
PTPAQ15257 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPAQ15257 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTPAQ15257 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTPAQ15257 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTPAQ15257 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTPAQ15257 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTPAQ15257 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PTPAQ15257 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPAQ15257 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTPAQ15257 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PTPAQ15257 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPAQ15257 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPAQ15257 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPAQ15257 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTPAQ15257 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPAQ15257 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPAQ15257 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPAQ15257 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPAQ15257 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPAQ15257 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTPAQ15257 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPAQ15257 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPAQ15257 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPAQ15257 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPAQ15257 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PTPAQ15257 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PTPAQ15257 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPAQ15257 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPAQ15257 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPAQ15257 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPAQ15257 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPAQ15257 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPAQ15257 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPAQ15257 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPAQ15257 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPAQ15257 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPAQ15257 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPAQ15257 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPAQ15257 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPAQ15257 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
PTPAQ15257 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPAQ15257 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPAQ15257 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPAQ15257 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPAQ15257 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPAQ15257 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPAQ15257 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPAQ15257 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPAQ15257 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPAQ15257 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPAQ15257 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPAQ15257 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPAQ15257 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPAQ15257 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPAQ15257 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPAQ15257 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPAQ15257 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPAQ15257 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPAQ15257 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTPAQ15257 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPAQ15257 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PTPAQ15257 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPAQ15257 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPAQ15257 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPAQ15257 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
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