Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNB1Q14721 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNB1Q14721 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNB1Q14721 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNB1Q14721 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNB1Q14721 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNB1Q14721 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNB1Q14721 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNB1Q14721 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNB1Q14721 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNB1Q14721 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNB1Q14721 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNB1Q14721 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNB1Q14721 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNB1Q14721 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNB1Q14721 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNB1Q14721 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNB1Q14721 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNB1Q14721 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNB1Q14721 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
KCNB1Q14721 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNB1Q14721 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNB1Q14721 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNB1Q14721 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNB1Q14721 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNB1Q14721 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNB1Q14721 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNB1Q14721 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNB1Q14721 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNB1Q14721 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNB1Q14721 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNB1Q14721 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNB1Q14721 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNB1Q14721 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNB1Q14721 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNB1Q14721 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNB1Q14721 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNB1Q14721 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KCNB1Q14721 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNB1Q14721 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNB1Q14721 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNB1Q14721 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNB1Q14721 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNB1Q14721 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNB1Q14721 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNB1Q14721 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNB1Q14721 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNB1Q14721 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNB1Q14721 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNB1Q14721 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNB1Q14721 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNB1Q14721 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNB1Q14721 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNB1Q14721 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNB1Q14721 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNB1Q14721 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNB1Q14721 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNB1Q14721 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNB1Q14721 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNB1Q14721 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNB1Q14721 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNB1Q14721 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNB1Q14721 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNB1Q14721 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNB1Q14721 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNB1Q14721 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KCNB1Q14721 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KCNB1Q14721 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
KCNB1Q14721 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KCNB1Q14721 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNB1Q14721 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNB1Q14721 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNB1Q14721 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNB1Q14721 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNB1Q14721 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNB1Q14721 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNB1Q14721 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNB1Q14721 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNB1Q14721 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNB1Q14721 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNB1Q14721 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNB1Q14721 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNB1Q14721 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNB1Q14721 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNB1Q14721 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNB1Q14721 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNB1Q14721 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNB1Q14721 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNB1Q14721 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNB1Q14721 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNB1Q14721 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNB1Q14721 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNB1Q14721 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNB1Q14721 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNB1Q14721 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNB1Q14721 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNB1Q14721 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNB1Q14721 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNB1Q14721 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNB1Q14721 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms