Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE7AQ13946 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE7AQ13946 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE7AQ13946 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE7AQ13946 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE7AQ13946 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE7AQ13946 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE7AQ13946 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE7AQ13946 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE7AQ13946 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE7AQ13946 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE7AQ13946 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE7AQ13946 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE7AQ13946 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE7AQ13946 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE7AQ13946 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE7AQ13946 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE7AQ13946 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE7AQ13946 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE7AQ13946 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE7AQ13946 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE7AQ13946 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE7AQ13946 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE7AQ13946 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE7AQ13946 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE7AQ13946 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE7AQ13946 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE7AQ13946 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE7AQ13946 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE7AQ13946 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE7AQ13946 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE7AQ13946 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE7AQ13946 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE7AQ13946 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE7AQ13946 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE7AQ13946 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDE7AQ13946 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDE7AQ13946 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE7AQ13946 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE7AQ13946 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE7AQ13946 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE7AQ13946 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE7AQ13946 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE7AQ13946 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE7AQ13946 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE7AQ13946 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE7AQ13946 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE7AQ13946 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE7AQ13946 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE7AQ13946 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE7AQ13946 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE7AQ13946 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE7AQ13946 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE7AQ13946 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE7AQ13946 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE7AQ13946 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE7AQ13946 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE7AQ13946 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE7AQ13946 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE7AQ13946 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE7AQ13946 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE7AQ13946 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE7AQ13946 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE7AQ13946 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE7AQ13946 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE7AQ13946 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE7AQ13946 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE7AQ13946 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
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