Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2H2Q13888 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2H2Q13888 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2H2Q13888 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2H2Q13888 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2H2Q13888 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2H2Q13888 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2H2Q13888 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2H2Q13888 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2H2Q13888 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2H2Q13888 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2H2Q13888 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2H2Q13888 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2H2Q13888 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2H2Q13888 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2H2Q13888 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2H2Q13888 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2H2Q13888 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2H2Q13888 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2H2Q13888 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2H2Q13888 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2H2Q13888 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2H2Q13888 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2H2Q13888 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2H2Q13888 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2H2Q13888 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2H2Q13888 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2H2Q13888 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF2H2Q13888 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2H2Q13888 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2H2Q13888 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2H2Q13888 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2H2Q13888 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2H2Q13888 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2H2Q13888 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2H2Q13888 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2H2Q13888 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2H2Q13888 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2H2Q13888 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2H2Q13888 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2H2Q13888 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2H2Q13888 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2H2Q13888 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2H2Q13888 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2H2Q13888 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2H2Q13888 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2H2Q13888 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2H2Q13888 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2H2Q13888 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2H2Q13888 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2H2Q13888 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2H2Q13888 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2H2Q13888 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2H2Q13888 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2H2Q13888 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2H2Q13888 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2H2Q13888 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2H2Q13888 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2H2Q13888 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2H2Q13888 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2H2Q13888 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2H2Q13888 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2H2Q13888 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2H2Q13888 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2H2Q13888 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2H2Q13888 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2H2Q13888 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2H2Q13888 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2H2Q13888 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
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