Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERCC8Q13216 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERCC8Q13216 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms