Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC8Q13216 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC8Q13216 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC8Q13216 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC8Q13216 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC8Q13216 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC8Q13216 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC8Q13216 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC8Q13216 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC8Q13216 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC8Q13216 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC8Q13216 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC8Q13216 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC8Q13216 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC8Q13216 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERCC8Q13216 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERCC8Q13216 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC8Q13216 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC8Q13216 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC8Q13216 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC8Q13216 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC8Q13216 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERCC8Q13216 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC8Q13216 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC8Q13216 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC8Q13216 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC8Q13216 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERCC8Q13216 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC8Q13216 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC8Q13216 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERCC8Q13216 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC8Q13216 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC8Q13216 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC8Q13216 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC8Q13216 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC8Q13216 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC8Q13216 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC8Q13216 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC8Q13216 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC8Q13216 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC8Q13216 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC8Q13216 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC8Q13216 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC8Q13216 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC8Q13216 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC8Q13216 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC8Q13216 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC8Q13216 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC8Q13216 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC8Q13216 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC8Q13216 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC8Q13216 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC8Q13216 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC8Q13216 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC8Q13216 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERCC8Q13216 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERCC8Q13216 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC8Q13216 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC8Q13216 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC8Q13216 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC8Q13216 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC8Q13216 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC8Q13216 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC8Q13216 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC8Q13216 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC8Q13216 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC8Q13216 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC8Q13216 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC8Q13216 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC8Q13216 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC8Q13216 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC8Q13216 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERCC8Q13216 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERCC8Q13216 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC8Q13216 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC8Q13216 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC8Q13216 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC8Q13216 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC8Q13216 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC8Q13216 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERCC8Q13216 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERCC8Q13216 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERCC8Q13216 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERCC8Q13216 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERCC8Q13216 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERCC8Q13216 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERCC8Q13216 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ERCC8Q13216 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERCC8Q13216 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERCC8Q13216 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERCC8Q13216 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERCC8Q13216 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERCC8Q13216 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERCC8Q13216 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERCC8Q13216 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERCC8Q13216 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERCC8Q13216 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERCC8Q13216 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERCC8Q13216 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERCC8Q13216 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms