Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALCOCO2Q13137 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALCOCO2Q13137 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALCOCO2Q13137 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALCOCO2Q13137 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALCOCO2Q13137 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALCOCO2Q13137 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALCOCO2Q13137 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CALCOCO2Q13137 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALCOCO2Q13137 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALCOCO2Q13137 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALCOCO2Q13137 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALCOCO2Q13137 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALCOCO2Q13137 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CALCOCO2Q13137 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALCOCO2Q13137 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALCOCO2Q13137 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CALCOCO2Q13137 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALCOCO2Q13137 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALCOCO2Q13137 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALCOCO2Q13137 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALCOCO2Q13137 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CALCOCO2Q13137 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALCOCO2Q13137 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALCOCO2Q13137 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALCOCO2Q13137 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CALCOCO2Q13137 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALCOCO2Q13137 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALCOCO2Q13137 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALCOCO2Q13137 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALCOCO2Q13137 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALCOCO2Q13137 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALCOCO2Q13137 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALCOCO2Q13137 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALCOCO2Q13137 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALCOCO2Q13137 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALCOCO2Q13137 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALCOCO2Q13137 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALCOCO2Q13137 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALCOCO2Q13137 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALCOCO2Q13137 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALCOCO2Q13137 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALCOCO2Q13137 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALCOCO2Q13137 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALCOCO2Q13137 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALCOCO2Q13137 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALCOCO2Q13137 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALCOCO2Q13137 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALCOCO2Q13137 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALCOCO2Q13137 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALCOCO2Q13137 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALCOCO2Q13137 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALCOCO2Q13137 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALCOCO2Q13137 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALCOCO2Q13137 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALCOCO2Q13137 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALCOCO2Q13137 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALCOCO2Q13137 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALCOCO2Q13137 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALCOCO2Q13137 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALCOCO2Q13137 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALCOCO2Q13137 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALCOCO2Q13137 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALCOCO2Q13137 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALCOCO2Q13137 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CALCOCO2Q13137 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALCOCO2Q13137 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALCOCO2Q13137 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALCOCO2Q13137 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALCOCO2Q13137 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CALCOCO2Q13137 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CALCOCO2Q13137 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CALCOCO2Q13137 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CALCOCO2Q13137 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALCOCO2Q13137 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALCOCO2Q13137 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALCOCO2Q13137 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CALCOCO2Q13137 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALCOCO2Q13137 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALCOCO2Q13137 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALCOCO2Q13137 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALCOCO2Q13137 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALCOCO2Q13137 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALCOCO2Q13137 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALCOCO2Q13137 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALCOCO2Q13137 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALCOCO2Q13137 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALCOCO2Q13137 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALCOCO2Q13137 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALCOCO2Q13137 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALCOCO2Q13137 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALCOCO2Q13137 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CALCOCO2Q13137 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
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