Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTN1Q12860 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTN1Q12860 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTN1Q12860 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTN1Q12860 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTN1Q12860 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTN1Q12860 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNTN1Q12860 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTN1Q12860 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTN1Q12860 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN1Q12860 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN1Q12860 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN1Q12860 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN1Q12860 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN1Q12860 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN1Q12860 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN1Q12860 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTN1Q12860 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTN1Q12860 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTN1Q12860 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTN1Q12860 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTN1Q12860 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN1Q12860 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN1Q12860 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN1Q12860 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN1Q12860 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTN1Q12860 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTN1Q12860 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN1Q12860 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN1Q12860 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN1Q12860 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN1Q12860 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN1Q12860 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN1Q12860 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN1Q12860 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN1Q12860 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN1Q12860 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN1Q12860 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN1Q12860 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN1Q12860 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN1Q12860 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN1Q12860 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN1Q12860 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN1Q12860 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN1Q12860 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN1Q12860 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN1Q12860 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN1Q12860 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN1Q12860 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN1Q12860 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN1Q12860 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN1Q12860 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN1Q12860 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN1Q12860 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN1Q12860 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN1Q12860 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN1Q12860 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN1Q12860 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN1Q12860 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN1Q12860 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTN1Q12860 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTN1Q12860 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTN1Q12860 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTN1Q12860 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN1Q12860 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN1Q12860 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN1Q12860 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN1Q12860 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN1Q12860 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN1Q12860 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTN1Q12860 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTN1Q12860 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTN1Q12860 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTN1Q12860 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTN1Q12860 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTN1Q12860 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTN1Q12860 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNTN1Q12860 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNTN1Q12860 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTN1Q12860 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTN1Q12860 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN1Q12860 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN1Q12860 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTN1Q12860 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTN1Q12860 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTN1Q12860 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN1Q12860 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN1Q12860 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN1Q12860 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN1Q12860 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN1Q12860 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN1Q12860 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN1Q12860 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN1Q12860 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN1Q12860 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN1Q12860 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN1Q12860 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN1Q12860 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN1Q12860 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN1Q12860 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
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