Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ELP6Q0PNE2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ELP6Q0PNE2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ELP6Q0PNE2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ELP6Q0PNE2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ELP6Q0PNE2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ELP6Q0PNE2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ELP6Q0PNE2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ELP6Q0PNE2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ELP6Q0PNE2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ELP6Q0PNE2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ELP6Q0PNE2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ELP6Q0PNE2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ELP6Q0PNE2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ELP6Q0PNE2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ELP6Q0PNE2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ELP6Q0PNE2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ELP6Q0PNE2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ELP6Q0PNE2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ELP6Q0PNE2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ELP6Q0PNE2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ELP6Q0PNE2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ELP6Q0PNE2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ELP6Q0PNE2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ELP6Q0PNE2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ELP6Q0PNE2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ELP6Q0PNE2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ELP6Q0PNE2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ELP6Q0PNE2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ELP6Q0PNE2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ELP6Q0PNE2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ELP6Q0PNE2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ELP6Q0PNE2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ELP6Q0PNE2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ELP6Q0PNE2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ELP6Q0PNE2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ELP6Q0PNE2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ELP6Q0PNE2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ELP6Q0PNE2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ELP6Q0PNE2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ELP6Q0PNE2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ELP6Q0PNE2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ELP6Q0PNE2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ELP6Q0PNE2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ELP6Q0PNE2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ELP6Q0PNE2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ELP6Q0PNE2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ELP6Q0PNE2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ELP6Q0PNE2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ELP6Q0PNE2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ELP6Q0PNE2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ELP6Q0PNE2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ELP6Q0PNE2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ELP6Q0PNE2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ELP6Q0PNE2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ELP6Q0PNE2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ELP6Q0PNE2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ELP6Q0PNE2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ELP6Q0PNE2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ELP6Q0PNE2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ELP6Q0PNE2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ELP6Q0PNE2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ELP6Q0PNE2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ELP6Q0PNE2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ELP6Q0PNE2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ELP6Q0PNE2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ELP6Q0PNE2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ELP6Q0PNE2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ELP6Q0PNE2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ELP6Q0PNE2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ELP6Q0PNE2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ELP6Q0PNE2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ELP6Q0PNE2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ELP6Q0PNE2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ELP6Q0PNE2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ELP6Q0PNE2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ELP6Q0PNE2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ELP6Q0PNE2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ELP6Q0PNE2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ELP6Q0PNE2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ELP6Q0PNE2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ELP6Q0PNE2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ELP6Q0PNE2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ELP6Q0PNE2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ELP6Q0PNE2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ELP6Q0PNE2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ELP6Q0PNE2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ELP6Q0PNE2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ELP6Q0PNE2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ELP6Q0PNE2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ELP6Q0PNE2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ELP6Q0PNE2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ELP6Q0PNE2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ELP6Q0PNE2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ELP6Q0PNE2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ELP6Q0PNE2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ELP6Q0PNE2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ELP6Q0PNE2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ELP6Q0PNE2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
ELP6Q0PNE2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms