Protein–RNA interactions for Protein: Q00005

PPP2R2B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2BQ00005 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP2R2BQ00005 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP2R2BQ00005 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP2R2BQ00005 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP2R2BQ00005 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP2R2BQ00005 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP2R2BQ00005 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP2R2BQ00005 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP2R2BQ00005 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP2R2BQ00005 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP2R2BQ00005 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP2R2BQ00005 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP2R2BQ00005 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPP2R2BQ00005 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP2R2BQ00005 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP2R2BQ00005 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP2R2BQ00005 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP2R2BQ00005 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP2R2BQ00005 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP2R2BQ00005 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP2R2BQ00005 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPP2R2BQ00005 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPP2R2BQ00005 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPP2R2BQ00005 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPP2R2BQ00005 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPP2R2BQ00005 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP2R2BQ00005 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP2R2BQ00005 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP2R2BQ00005 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP2R2BQ00005 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP2R2BQ00005 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP2R2BQ00005 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP2R2BQ00005 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP2R2BQ00005 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP2R2BQ00005 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP2R2BQ00005 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP2R2BQ00005 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP2R2BQ00005 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP2R2BQ00005 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP2R2BQ00005 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP2R2BQ00005 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPP2R2BQ00005 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPP2R2BQ00005 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP2R2BQ00005 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP2R2BQ00005 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP2R2BQ00005 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP2R2BQ00005 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP2R2BQ00005 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP2R2BQ00005 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP2R2BQ00005 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP2R2BQ00005 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP2R2BQ00005 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP2R2BQ00005 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP2R2BQ00005 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP2R2BQ00005 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP2R2BQ00005 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP2R2BQ00005 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP2R2BQ00005 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP2R2BQ00005 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP2R2BQ00005 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP2R2BQ00005 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP2R2BQ00005 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP2R2BQ00005 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP2R2BQ00005 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP2R2BQ00005 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP2R2BQ00005 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPP2R2BQ00005 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms