Protein–RNA interactions for Protein: P80162

CXCL6, C-X-C motif chemokine 6, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL6P80162 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL6P80162 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL6P80162 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms