Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPS1P60891 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPS1P60891 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPS1P60891 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPS1P60891 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPS1P60891 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPS1P60891 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPS1P60891 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPS1P60891 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPS1P60891 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPS1P60891 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPS1P60891 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPS1P60891 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPS1P60891 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPS1P60891 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPS1P60891 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPS1P60891 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPS1P60891 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPS1P60891 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPS1P60891 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPS1P60891 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRPS1P60891 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPS1P60891 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRPS1P60891 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRPS1P60891 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPS1P60891 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPS1P60891 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPS1P60891 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPS1P60891 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPS1P60891 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPS1P60891 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPS1P60891 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPS1P60891 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPS1P60891 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPS1P60891 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPS1P60891 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPS1P60891 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPS1P60891 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPS1P60891 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPS1P60891 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPS1P60891 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPS1P60891 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPS1P60891 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPS1P60891 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPS1P60891 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPS1P60891 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPS1P60891 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms