Protein–RNA interactions for Protein: P55289

CDH12, Cadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH12P55289 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH12P55289 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH12P55289 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH12P55289 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH12P55289 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH12P55289 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH12P55289 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH12P55289 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH12P55289 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH12P55289 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH12P55289 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH12P55289 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH12P55289 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH12P55289 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH12P55289 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH12P55289 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH12P55289 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH12P55289 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH12P55289 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH12P55289 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH12P55289 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH12P55289 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH12P55289 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH12P55289 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH12P55289 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH12P55289 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH12P55289 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH12P55289 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH12P55289 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH12P55289 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH12P55289 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH12P55289 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH12P55289 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH12P55289 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH12P55289 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH12P55289 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH12P55289 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH12P55289 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH12P55289 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH12P55289 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH12P55289 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH12P55289 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH12P55289 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH12P55289 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH12P55289 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH12P55289 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH12P55289 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH12P55289 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH12P55289 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH12P55289 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH12P55289 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH12P55289 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH12P55289 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH12P55289 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH12P55289 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH12P55289 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH12P55289 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH12P55289 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH12P55289 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH12P55289 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH12P55289 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH12P55289 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH12P55289 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH12P55289 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH12P55289 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH12P55289 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH12P55289 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH12P55289 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH12P55289 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH12P55289 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH12P55289 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH12P55289 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH12P55289 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH12P55289 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH12P55289 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH12P55289 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH12P55289 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH12P55289 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH12P55289 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH12P55289 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH12P55289 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH12P55289 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH12P55289 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDH12P55289 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH12P55289 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH12P55289 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH12P55289 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH12P55289 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH12P55289 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH12P55289 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH12P55289 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH12P55289 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH12P55289 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH12P55289 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH12P55289 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH12P55289 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH12P55289 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH12P55289 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH12P55289 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH12P55289 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms