Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSC2P49815 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TSC2P49815 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSC2P49815 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSC2P49815 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSC2P49815 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSC2P49815 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSC2P49815 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSC2P49815 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSC2P49815 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSC2P49815 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TSC2P49815 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TSC2P49815 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSC2P49815 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSC2P49815 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSC2P49815 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSC2P49815 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSC2P49815 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSC2P49815 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSC2P49815 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSC2P49815 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSC2P49815 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSC2P49815 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSC2P49815 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSC2P49815 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSC2P49815 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSC2P49815 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSC2P49815 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSC2P49815 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSC2P49815 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSC2P49815 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSC2P49815 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSC2P49815 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TSC2P49815 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TSC2P49815 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSC2P49815 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSC2P49815 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSC2P49815 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSC2P49815 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSC2P49815 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSC2P49815 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSC2P49815 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSC2P49815 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSC2P49815 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSC2P49815 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSC2P49815 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSC2P49815 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSC2P49815 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSC2P49815 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSC2P49815 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSC2P49815 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSC2P49815 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSC2P49815 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSC2P49815 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSC2P49815 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSC2P49815 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSC2P49815 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSC2P49815 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSC2P49815 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSC2P49815 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSC2P49815 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSC2P49815 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSC2P49815 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSC2P49815 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSC2P49815 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSC2P49815 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSC2P49815 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSC2P49815 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSC2P49815 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSC2P49815 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSC2P49815 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSC2P49815 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSC2P49815 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSC2P49815 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSC2P49815 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSC2P49815 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSC2P49815 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSC2P49815 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSC2P49815 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSC2P49815 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSC2P49815 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSC2P49815 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSC2P49815 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSC2P49815 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSC2P49815 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TSC2P49815 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSC2P49815 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TSC2P49815 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSC2P49815 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSC2P49815 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSC2P49815 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TSC2P49815 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSC2P49815 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSC2P49815 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TSC2P49815 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSC2P49815 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSC2P49815 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSC2P49815 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSC2P49815 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSC2P49815 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 343.8 ms