Protein–RNA interactions for Protein: P49761

CLK3, Dual specificity protein kinase CLK3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK3P49761 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLK3P49761 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLK3P49761 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLK3P49761 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLK3P49761 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK3P49761 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK3P49761 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK3P49761 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK3P49761 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLK3P49761 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLK3P49761 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLK3P49761 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLK3P49761 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLK3P49761 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLK3P49761 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLK3P49761 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLK3P49761 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLK3P49761 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLK3P49761 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLK3P49761 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLK3P49761 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLK3P49761 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLK3P49761 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK3P49761 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK3P49761 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK3P49761 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK3P49761 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK3P49761 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK3P49761 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK3P49761 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK3P49761 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK3P49761 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK3P49761 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK3P49761 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK3P49761 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK3P49761 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLK3P49761 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLK3P49761 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLK3P49761 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLK3P49761 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLK3P49761 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLK3P49761 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLK3P49761 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLK3P49761 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLK3P49761 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLK3P49761 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLK3P49761 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLK3P49761 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLK3P49761 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLK3P49761 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLK3P49761 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLK3P49761 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLK3P49761 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLK3P49761 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLK3P49761 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLK3P49761 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLK3P49761 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLK3P49761 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLK3P49761 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK3P49761 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK3P49761 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLK3P49761 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLK3P49761 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLK3P49761 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLK3P49761 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLK3P49761 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLK3P49761 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLK3P49761 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLK3P49761 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CLK3P49761 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLK3P49761 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLK3P49761 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLK3P49761 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLK3P49761 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLK3P49761 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLK3P49761 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLK3P49761 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLK3P49761 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLK3P49761 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLK3P49761 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLK3P49761 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLK3P49761 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLK3P49761 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLK3P49761 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLK3P49761 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLK3P49761 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLK3P49761 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLK3P49761 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLK3P49761 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLK3P49761 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLK3P49761 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLK3P49761 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLK3P49761 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLK3P49761 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLK3P49761 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLK3P49761 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLK3P49761 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLK3P49761 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLK3P49761 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLK3P49761 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms