Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RECQLP46063 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RECQLP46063 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RECQLP46063 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RECQLP46063 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RECQLP46063 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RECQLP46063 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RECQLP46063 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RECQLP46063 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RECQLP46063 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RECQLP46063 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RECQLP46063 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RECQLP46063 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RECQLP46063 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RECQLP46063 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RECQLP46063 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RECQLP46063 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RECQLP46063 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RECQLP46063 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RECQLP46063 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RECQLP46063 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RECQLP46063 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RECQLP46063 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RECQLP46063 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RECQLP46063 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RECQLP46063 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RECQLP46063 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RECQLP46063 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RECQLP46063 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RECQLP46063 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RECQLP46063 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RECQLP46063 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RECQLP46063 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RECQLP46063 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RECQLP46063 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RECQLP46063 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RECQLP46063 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RECQLP46063 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RECQLP46063 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RECQLP46063 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RECQLP46063 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RECQLP46063 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RECQLP46063 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RECQLP46063 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RECQLP46063 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RECQLP46063 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RECQLP46063 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RECQLP46063 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RECQLP46063 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RECQLP46063 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RECQLP46063 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RECQLP46063 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RECQLP46063 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RECQLP46063 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RECQLP46063 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RECQLP46063 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RECQLP46063 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RECQLP46063 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RECQLP46063 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RECQLP46063 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RECQLP46063 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RECQLP46063 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RECQLP46063 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RECQLP46063 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RECQLP46063 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RECQLP46063 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RECQLP46063 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RECQLP46063 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RECQLP46063 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RECQLP46063 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RECQLP46063 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RECQLP46063 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RECQLP46063 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RECQLP46063 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RECQLP46063 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RECQLP46063 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RECQLP46063 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RECQLP46063 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RECQLP46063 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RECQLP46063 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RECQLP46063 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RECQLP46063 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RECQLP46063 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RECQLP46063 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RECQLP46063 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RECQLP46063 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RECQLP46063 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RECQLP46063 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RECQLP46063 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RECQLP46063 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RECQLP46063 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RECQLP46063 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RECQLP46063 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RECQLP46063 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RECQLP46063 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RECQLP46063 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RECQLP46063 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RECQLP46063 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RECQLP46063 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RECQLP46063 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms