Protein–RNA interactions for Protein: P25067

COL8A2, Collagen alpha-2(VIII) chain, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL8A2P25067 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL8A2P25067 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL8A2P25067 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COL8A2P25067 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL8A2P25067 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL8A2P25067 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL8A2P25067 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL8A2P25067 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL8A2P25067 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL8A2P25067 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL8A2P25067 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL8A2P25067 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL8A2P25067 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL8A2P25067 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL8A2P25067 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL8A2P25067 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL8A2P25067 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL8A2P25067 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL8A2P25067 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL8A2P25067 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL8A2P25067 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COL8A2P25067 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL8A2P25067 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL8A2P25067 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL8A2P25067 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL8A2P25067 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL8A2P25067 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL8A2P25067 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL8A2P25067 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL8A2P25067 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL8A2P25067 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL8A2P25067 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL8A2P25067 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL8A2P25067 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL8A2P25067 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL8A2P25067 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL8A2P25067 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL8A2P25067 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COL8A2P25067 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL8A2P25067 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL8A2P25067 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL8A2P25067 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL8A2P25067 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL8A2P25067 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL8A2P25067 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL8A2P25067 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL8A2P25067 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL8A2P25067 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL8A2P25067 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL8A2P25067 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL8A2P25067 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL8A2P25067 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL8A2P25067 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL8A2P25067 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL8A2P25067 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL8A2P25067 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL8A2P25067 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL8A2P25067 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL8A2P25067 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL8A2P25067 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL8A2P25067 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL8A2P25067 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL8A2P25067 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL8A2P25067 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL8A2P25067 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms