Protein–RNA interactions for Protein: P25067

COL8A2, Collagen alpha-2(VIII) chain, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL8A2P25067 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL8A2P25067 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL8A2P25067 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL8A2P25067 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL8A2P25067 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL8A2P25067 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL8A2P25067 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
COL8A2P25067 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL8A2P25067 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL8A2P25067 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL8A2P25067 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL8A2P25067 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL8A2P25067 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL8A2P25067 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL8A2P25067 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL8A2P25067 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL8A2P25067 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL8A2P25067 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL8A2P25067 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL8A2P25067 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL8A2P25067 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL8A2P25067 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL8A2P25067 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL8A2P25067 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL8A2P25067 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL8A2P25067 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL8A2P25067 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL8A2P25067 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COL8A2P25067 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL8A2P25067 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL8A2P25067 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL8A2P25067 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL8A2P25067 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL8A2P25067 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL8A2P25067 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL8A2P25067 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL8A2P25067 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL8A2P25067 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL8A2P25067 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
COL8A2P25067 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL8A2P25067 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL8A2P25067 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL8A2P25067 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL8A2P25067 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL8A2P25067 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL8A2P25067 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL8A2P25067 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL8A2P25067 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
COL8A2P25067 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL8A2P25067 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
COL8A2P25067 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL8A2P25067 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL8A2P25067 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL8A2P25067 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL8A2P25067 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL8A2P25067 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL8A2P25067 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL8A2P25067 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL8A2P25067 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL8A2P25067 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL8A2P25067 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL8A2P25067 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL8A2P25067 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL8A2P25067 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL8A2P25067 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL8A2P25067 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL8A2P25067 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL8A2P25067 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL8A2P25067 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL8A2P25067 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL8A2P25067 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL8A2P25067 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL8A2P25067 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL8A2P25067 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL8A2P25067 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
COL8A2P25067 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL8A2P25067 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL8A2P25067 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL8A2P25067 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL8A2P25067 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL8A2P25067 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL8A2P25067 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL8A2P25067 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL8A2P25067 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL8A2P25067 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL8A2P25067 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL8A2P25067 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL8A2P25067 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL8A2P25067 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL8A2P25067 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL8A2P25067 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL8A2P25067 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL8A2P25067 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL8A2P25067 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL8A2P25067 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL8A2P25067 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL8A2P25067 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL8A2P25067 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
COL8A2P25067 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL8A2P25067 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms