Protein–RNA interactions for Protein: P18084

ITGB5, Integrin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5P18084 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGB5P18084 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGB5P18084 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGB5P18084 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ITGB5P18084 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ITGB5P18084 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ITGB5P18084 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGB5P18084 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGB5P18084 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGB5P18084 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGB5P18084 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGB5P18084 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGB5P18084 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ITGB5P18084 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ITGB5P18084 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ITGB5P18084 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGB5P18084 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGB5P18084 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGB5P18084 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGB5P18084 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGB5P18084 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGB5P18084 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGB5P18084 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGB5P18084 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGB5P18084 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGB5P18084 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGB5P18084 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGB5P18084 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGB5P18084 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGB5P18084 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGB5P18084 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGB5P18084 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGB5P18084 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGB5P18084 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGB5P18084 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGB5P18084 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGB5P18084 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGB5P18084 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGB5P18084 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGB5P18084 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGB5P18084 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGB5P18084 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGB5P18084 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGB5P18084 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGB5P18084 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGB5P18084 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGB5P18084 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGB5P18084 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGB5P18084 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGB5P18084 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGB5P18084 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGB5P18084 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGB5P18084 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGB5P18084 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGB5P18084 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGB5P18084 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGB5P18084 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGB5P18084 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGB5P18084 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGB5P18084 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGB5P18084 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ITGB5P18084 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ITGB5P18084 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGB5P18084 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGB5P18084 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGB5P18084 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGB5P18084 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGB5P18084 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGB5P18084 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGB5P18084 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGB5P18084 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGB5P18084 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGB5P18084 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGB5P18084 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGB5P18084 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGB5P18084 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGB5P18084 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGB5P18084 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGB5P18084 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ITGB5P18084 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ITGB5P18084 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ITGB5P18084 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ITGB5P18084 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ITGB5P18084 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGB5P18084 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGB5P18084 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGB5P18084 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGB5P18084 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB5P18084 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB5P18084 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB5P18084 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGB5P18084 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGB5P18084 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGB5P18084 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGB5P18084 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGB5P18084 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGB5P18084 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGB5P18084 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ITGB5P18084 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms