Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCF2P10911 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCF2P10911 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCF2P10911 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCF2P10911 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCF2P10911 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCF2P10911 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCF2P10911 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MCF2P10911 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCF2P10911 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCF2P10911 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCF2P10911 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCF2P10911 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCF2P10911 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCF2P10911 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MCF2P10911 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCF2P10911 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCF2P10911 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCF2P10911 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCF2P10911 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MCF2P10911 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MCF2P10911 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
MCF2P10911 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MCF2P10911 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MCF2P10911 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCF2P10911 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCF2P10911 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCF2P10911 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCF2P10911 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCF2P10911 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCF2P10911 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCF2P10911 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCF2P10911 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MCF2P10911 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MCF2P10911 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MCF2P10911 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MCF2P10911 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCF2P10911 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCF2P10911 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCF2P10911 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCF2P10911 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCF2P10911 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCF2P10911 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MCF2P10911 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MCF2P10911 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCF2P10911 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCF2P10911 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCF2P10911 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCF2P10911 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCF2P10911 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCF2P10911 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MCF2P10911 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MCF2P10911 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCF2P10911 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCF2P10911 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCF2P10911 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCF2P10911 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCF2P10911 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCF2P10911 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MCF2P10911 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCF2P10911 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCF2P10911 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCF2P10911 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCF2P10911 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCF2P10911 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCF2P10911 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCF2P10911 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCF2P10911 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCF2P10911 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCF2P10911 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCF2P10911 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCF2P10911 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCF2P10911 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCF2P10911 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCF2P10911 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MCF2P10911 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCF2P10911 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCF2P10911 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCF2P10911 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCF2P10911 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCF2P10911 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCF2P10911 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCF2P10911 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCF2P10911 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCF2P10911 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCF2P10911 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCF2P10911 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCF2P10911 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCF2P10911 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCF2P10911 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCF2P10911 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCF2P10911 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCF2P10911 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCF2P10911 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCF2P10911 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCF2P10911 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MCF2P10911 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCF2P10911 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MCF2P10911 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCF2P10911 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms