Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPLP06858 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPLP06858 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPLP06858 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPLP06858 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPLP06858 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPLP06858 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPLP06858 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPLP06858 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPLP06858 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPLP06858 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPLP06858 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPLP06858 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPLP06858 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPLP06858 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPLP06858 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPLP06858 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LPLP06858 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPLP06858 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPLP06858 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPLP06858 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LPLP06858 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPLP06858 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LPLP06858 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LPLP06858 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LPLP06858 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LPLP06858 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LPLP06858 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LPLP06858 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LPLP06858 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LPLP06858 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LPLP06858 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LPLP06858 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LPLP06858 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LPLP06858 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LPLP06858 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LPLP06858 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPLP06858 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPLP06858 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPLP06858 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPLP06858 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LPLP06858 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LPLP06858 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LPLP06858 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LPLP06858 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LPLP06858 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LPLP06858 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LPLP06858 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LPLP06858 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LPLP06858 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LPLP06858 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LPLP06858 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LPLP06858 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LPLP06858 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LPLP06858 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LPLP06858 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LPLP06858 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LPLP06858 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LPLP06858 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LPLP06858 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LPLP06858 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LPLP06858 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LPLP06858 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LPLP06858 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LPLP06858 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LPLP06858 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LPLP06858 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LPLP06858 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LPLP06858 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LPLP06858 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LPLP06858 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LPLP06858 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LPLP06858 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LPLP06858 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LPLP06858 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LPLP06858 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LPLP06858 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LPLP06858 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LPLP06858 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LPLP06858 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LPLP06858 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LPLP06858 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LPLP06858 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LPLP06858 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LPLP06858 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LPLP06858 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LPLP06858 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LPLP06858 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LPLP06858 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LPLP06858 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LPLP06858 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LPLP06858 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LPLP06858 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LPLP06858 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LPLP06858 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LPLP06858 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LPLP06858 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LPLP06858 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LPLP06858 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LPLP06858 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms