Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOC2P02655 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOC2P02655 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
APOC2P02655 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOC2P02655 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOC2P02655 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOC2P02655 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOC2P02655 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOC2P02655 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOC2P02655 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOC2P02655 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOC2P02655 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOC2P02655 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOC2P02655 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOC2P02655 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOC2P02655 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOC2P02655 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
APOC2P02655 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOC2P02655 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
APOC2P02655 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOC2P02655 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOC2P02655 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
APOC2P02655 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOC2P02655 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOC2P02655 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOC2P02655 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOC2P02655 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOC2P02655 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOC2P02655 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOC2P02655 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOC2P02655 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOC2P02655 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOC2P02655 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
APOC2P02655 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOC2P02655 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOC2P02655 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOC2P02655 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOC2P02655 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
APOC2P02655 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOC2P02655 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
APOC2P02655 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
APOC2P02655 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOC2P02655 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOC2P02655 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOC2P02655 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOC2P02655 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOC2P02655 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOC2P02655 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOC2P02655 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOC2P02655 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOC2P02655 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOC2P02655 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOC2P02655 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOC2P02655 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOC2P02655 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOC2P02655 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOC2P02655 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOC2P02655 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOC2P02655 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOC2P02655 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOC2P02655 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOC2P02655 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
APOC2P02655 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOC2P02655 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
APOC2P02655 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOC2P02655 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
APOC2P02655 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
APOC2P02655 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOC2P02655 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
APOC2P02655 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOC2P02655 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOC2P02655 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOC2P02655 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOC2P02655 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOC2P02655 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOC2P02655 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
APOC2P02655 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOC2P02655 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOC2P02655 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOC2P02655 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOC2P02655 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOC2P02655 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOC2P02655 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOC2P02655 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
APOC2P02655 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOC2P02655 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOC2P02655 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOC2P02655 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOC2P02655 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOC2P02655 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
APOC2P02655 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOC2P02655 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOC2P02655 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOC2P02655 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOC2P02655 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOC2P02655 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOC2P02655 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOC2P02655 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOC2P02655 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOC2P02655 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms