Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCNE2O96020 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCNE2O96020 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCNE2O96020 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCNE2O96020 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCNE2O96020 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCNE2O96020 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCNE2O96020 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCNE2O96020 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNE2O96020 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNE2O96020 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNE2O96020 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNE2O96020 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNE2O96020 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCNE2O96020 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCNE2O96020 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCNE2O96020 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNE2O96020 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNE2O96020 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNE2O96020 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNE2O96020 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCNE2O96020 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCNE2O96020 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCNE2O96020 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCNE2O96020 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCNE2O96020 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCNE2O96020 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCNE2O96020 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCNE2O96020 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCNE2O96020 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCNE2O96020 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCNE2O96020 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCNE2O96020 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCNE2O96020 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCNE2O96020 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNE2O96020 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNE2O96020 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNE2O96020 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNE2O96020 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNE2O96020 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNE2O96020 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNE2O96020 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNE2O96020 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCNE2O96020 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCNE2O96020 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCNE2O96020 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCNE2O96020 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNE2O96020 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNE2O96020 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNE2O96020 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNE2O96020 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNE2O96020 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNE2O96020 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNE2O96020 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNE2O96020 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNE2O96020 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNE2O96020 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCNE2O96020 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCNE2O96020 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCNE2O96020 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCNE2O96020 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCNE2O96020 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCNE2O96020 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCNE2O96020 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCNE2O96020 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCNE2O96020 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNE2O96020 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNE2O96020 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNE2O96020 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNE2O96020 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNE2O96020 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNE2O96020 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNE2O96020 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNE2O96020 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNE2O96020 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNE2O96020 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCNE2O96020 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCNE2O96020 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCNE2O96020 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCNE2O96020 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCNE2O96020 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCNE2O96020 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCNE2O96020 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCNE2O96020 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCNE2O96020 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCNE2O96020 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCNE2O96020 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCNE2O96020 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCNE2O96020 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCNE2O96020 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCNE2O96020 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCNE2O96020 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCNE2O96020 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCNE2O96020 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCNE2O96020 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCNE2O96020 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCNE2O96020 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCNE2O96020 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCNE2O96020 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCNE2O96020 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms