Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BRD1O95696 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BRD1O95696 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BRD1O95696 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BRD1O95696 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
BRD1O95696 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
BRD1O95696 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
BRD1O95696 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
BRD1O95696 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRD1O95696 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRD1O95696 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRD1O95696 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
BRD1O95696 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
BRD1O95696 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
BRD1O95696 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRD1O95696 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRD1O95696 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRD1O95696 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRD1O95696 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRD1O95696 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRD1O95696 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRD1O95696 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRD1O95696 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRD1O95696 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRD1O95696 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRD1O95696 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
BRD1O95696 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRD1O95696 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRD1O95696 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRD1O95696 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRD1O95696 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRD1O95696 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRD1O95696 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
BRD1O95696 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRD1O95696 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRD1O95696 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRD1O95696 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRD1O95696 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BRD1O95696 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BRD1O95696 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BRD1O95696 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
BRD1O95696 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
BRD1O95696 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRD1O95696 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRD1O95696 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRD1O95696 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRD1O95696 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRD1O95696 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRD1O95696 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRD1O95696 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRD1O95696 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BRD1O95696 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BRD1O95696 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRD1O95696 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BRD1O95696 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BRD1O95696 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BRD1O95696 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BRD1O95696 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.37
BRD1O95696 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRD1O95696 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRD1O95696 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRD1O95696 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
BRD1O95696 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRD1O95696 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRD1O95696 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRD1O95696 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRD1O95696 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRD1O95696 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRD1O95696 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRD1O95696 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRD1O95696 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRD1O95696 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRD1O95696 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRD1O95696 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRD1O95696 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BRD1O95696 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BRD1O95696 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BRD1O95696 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BRD1O95696 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRD1O95696 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRD1O95696 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRD1O95696 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BRD1O95696 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BRD1O95696 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BRD1O95696 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRD1O95696 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRD1O95696 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRD1O95696 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRD1O95696 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
BRD1O95696 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
BRD1O95696 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRD1O95696 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRD1O95696 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRD1O95696 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRD1O95696 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRD1O95696 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRD1O95696 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRD1O95696 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
BRD1O95696 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRD1O95696 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms