Protein–RNA interactions for Protein: O94886

TMEM63A, CSC1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM63AO94886 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM63AO94886 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM63AO94886 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM63AO94886 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM63AO94886 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM63AO94886 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM63AO94886 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM63AO94886 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM63AO94886 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM63AO94886 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM63AO94886 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM63AO94886 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM63AO94886 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM63AO94886 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM63AO94886 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM63AO94886 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM63AO94886 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM63AO94886 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM63AO94886 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM63AO94886 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM63AO94886 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM63AO94886 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM63AO94886 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM63AO94886 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM63AO94886 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM63AO94886 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM63AO94886 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM63AO94886 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM63AO94886 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM63AO94886 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM63AO94886 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM63AO94886 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM63AO94886 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM63AO94886 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM63AO94886 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM63AO94886 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM63AO94886 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM63AO94886 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM63AO94886 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM63AO94886 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM63AO94886 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM63AO94886 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM63AO94886 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM63AO94886 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM63AO94886 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM63AO94886 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM63AO94886 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM63AO94886 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM63AO94886 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM63AO94886 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM63AO94886 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM63AO94886 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM63AO94886 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM63AO94886 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM63AO94886 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM63AO94886 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM63AO94886 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM63AO94886 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM63AO94886 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMEM63AO94886 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM63AO94886 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM63AO94886 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM63AO94886 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM63AO94886 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM63AO94886 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM63AO94886 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM63AO94886 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM63AO94886 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM63AO94886 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM63AO94886 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM63AO94886 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.5 ms