Protein–RNA interactions for Protein: O94806

PRKD3, Serine/threonine-protein kinase D3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD3O94806 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKD3O94806 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKD3O94806 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKD3O94806 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKD3O94806 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKD3O94806 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKD3O94806 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKD3O94806 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKD3O94806 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKD3O94806 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKD3O94806 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKD3O94806 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKD3O94806 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKD3O94806 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKD3O94806 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKD3O94806 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKD3O94806 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKD3O94806 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKD3O94806 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKD3O94806 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKD3O94806 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKD3O94806 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKD3O94806 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKD3O94806 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKD3O94806 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKD3O94806 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKD3O94806 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKD3O94806 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKD3O94806 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKD3O94806 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKD3O94806 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKD3O94806 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKD3O94806 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKD3O94806 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKD3O94806 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKD3O94806 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKD3O94806 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRKD3O94806 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKD3O94806 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKD3O94806 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKD3O94806 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKD3O94806 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKD3O94806 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKD3O94806 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKD3O94806 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKD3O94806 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKD3O94806 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD3O94806 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD3O94806 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD3O94806 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD3O94806 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKD3O94806 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKD3O94806 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKD3O94806 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKD3O94806 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKD3O94806 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKD3O94806 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKD3O94806 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKD3O94806 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKD3O94806 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKD3O94806 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKD3O94806 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKD3O94806 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms