Protein–RNA interactions for Protein: O75437

ZNF254, Zinc finger protein 254, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF254O75437 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF254O75437 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF254O75437 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF254O75437 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF254O75437 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF254O75437 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF254O75437 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF254O75437 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF254O75437 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF254O75437 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF254O75437 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF254O75437 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF254O75437 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF254O75437 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF254O75437 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF254O75437 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF254O75437 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF254O75437 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF254O75437 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF254O75437 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF254O75437 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF254O75437 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF254O75437 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF254O75437 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF254O75437 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF254O75437 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF254O75437 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF254O75437 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF254O75437 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF254O75437 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF254O75437 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF254O75437 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF254O75437 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms