Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TSPAN6O43657 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSPAN6O43657 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSPAN6O43657 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSPAN6O43657 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSPAN6O43657 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSPAN6O43657 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSPAN6O43657 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSPAN6O43657 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSPAN6O43657 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSPAN6O43657 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSPAN6O43657 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSPAN6O43657 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSPAN6O43657 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSPAN6O43657 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSPAN6O43657 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSPAN6O43657 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSPAN6O43657 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSPAN6O43657 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSPAN6O43657 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSPAN6O43657 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSPAN6O43657 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSPAN6O43657 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSPAN6O43657 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSPAN6O43657 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSPAN6O43657 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSPAN6O43657 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSPAN6O43657 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSPAN6O43657 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSPAN6O43657 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSPAN6O43657 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSPAN6O43657 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSPAN6O43657 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TSPAN6O43657 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSPAN6O43657 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSPAN6O43657 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSPAN6O43657 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSPAN6O43657 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSPAN6O43657 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSPAN6O43657 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSPAN6O43657 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSPAN6O43657 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSPAN6O43657 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSPAN6O43657 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSPAN6O43657 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSPAN6O43657 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSPAN6O43657 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSPAN6O43657 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSPAN6O43657 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSPAN6O43657 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN6O43657 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN6O43657 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSPAN6O43657 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSPAN6O43657 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSPAN6O43657 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSPAN6O43657 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSPAN6O43657 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSPAN6O43657 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSPAN6O43657 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms