Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TSPAN6O43657 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TSPAN6O43657 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TSPAN6O43657 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TSPAN6O43657 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TSPAN6O43657 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TSPAN6O43657 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
TSPAN6O43657 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TSPAN6O43657 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TSPAN6O43657 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TSPAN6O43657 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
TSPAN6O43657 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
TSPAN6O43657 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TSPAN6O43657 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TSPAN6O43657 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TSPAN6O43657 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TSPAN6O43657 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TSPAN6O43657 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TSPAN6O43657 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TSPAN6O43657 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
TSPAN6O43657 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TSPAN6O43657 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TSPAN6O43657 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TSPAN6O43657 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TSPAN6O43657 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TSPAN6O43657 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TSPAN6O43657 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TSPAN6O43657 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TSPAN6O43657 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TSPAN6O43657 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TSPAN6O43657 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TSPAN6O43657 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TSPAN6O43657 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TSPAN6O43657 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TSPAN6O43657 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TSPAN6O43657 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TSPAN6O43657 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TSPAN6O43657 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TSPAN6O43657 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TSPAN6O43657 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
TSPAN6O43657 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TSPAN6O43657 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TSPAN6O43657 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TSPAN6O43657 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TSPAN6O43657 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TSPAN6O43657 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TSPAN6O43657 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TSPAN6O43657 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
TSPAN6O43657 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TSPAN6O43657 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TSPAN6O43657 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TSPAN6O43657 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TSPAN6O43657 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TSPAN6O43657 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TSPAN6O43657 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TSPAN6O43657 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TSPAN6O43657 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TSPAN6O43657 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TSPAN6O43657 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TSPAN6O43657 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TSPAN6O43657 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TSPAN6O43657 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TSPAN6O43657 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TSPAN6O43657 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TSPAN6O43657 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TSPAN6O43657 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TSPAN6O43657 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TSPAN6O43657 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TSPAN6O43657 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TSPAN6O43657 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TSPAN6O43657 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TSPAN6O43657 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TSPAN6O43657 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TSPAN6O43657 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TSPAN6O43657 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TSPAN6O43657 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TSPAN6O43657 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TSPAN6O43657 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TSPAN6O43657 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TSPAN6O43657 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TSPAN6O43657 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TSPAN6O43657 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TSPAN6O43657 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TSPAN6O43657 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TSPAN6O43657 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TSPAN6O43657 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TSPAN6O43657 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TSPAN6O43657 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TSPAN6O43657 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TSPAN6O43657 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TSPAN6O43657 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TSPAN6O43657 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TSPAN6O43657 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TSPAN6O43657 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TSPAN6O43657 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TSPAN6O43657 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TSPAN6O43657 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TSPAN6O43657 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TSPAN6O43657 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TSPAN6O43657 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms