Protein–RNA interactions for Protein: O43508

TNFSF12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12O43508 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFSF12O43508 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFSF12O43508 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TNFSF12O43508 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFSF12O43508 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFSF12O43508 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFSF12O43508 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNFSF12O43508 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNFSF12O43508 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TNFSF12O43508 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TNFSF12O43508 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNFSF12O43508 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFSF12O43508 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFSF12O43508 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFSF12O43508 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFSF12O43508 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms