Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCP110O43303 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCP110O43303 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCP110O43303 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCP110O43303 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCP110O43303 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCP110O43303 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCP110O43303 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCP110O43303 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCP110O43303 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCP110O43303 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCP110O43303 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCP110O43303 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCP110O43303 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCP110O43303 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCP110O43303 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCP110O43303 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCP110O43303 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCP110O43303 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCP110O43303 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCP110O43303 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCP110O43303 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCP110O43303 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCP110O43303 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCP110O43303 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCP110O43303 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCP110O43303 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCP110O43303 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCP110O43303 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCP110O43303 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCP110O43303 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCP110O43303 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCP110O43303 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCP110O43303 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCP110O43303 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCP110O43303 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCP110O43303 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCP110O43303 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCP110O43303 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCP110O43303 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCP110O43303 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCP110O43303 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCP110O43303 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCP110O43303 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCP110O43303 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCP110O43303 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCP110O43303 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCP110O43303 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCP110O43303 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCP110O43303 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCP110O43303 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCP110O43303 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCP110O43303 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCP110O43303 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCP110O43303 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCP110O43303 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCP110O43303 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCP110O43303 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCP110O43303 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCP110O43303 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCP110O43303 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCP110O43303 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCP110O43303 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCP110O43303 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCP110O43303 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCP110O43303 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCP110O43303 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCP110O43303 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CCP110O43303 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCP110O43303 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCP110O43303 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCP110O43303 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCP110O43303 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCP110O43303 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCP110O43303 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCP110O43303 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCP110O43303 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCP110O43303 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCP110O43303 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCP110O43303 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCP110O43303 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCP110O43303 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCP110O43303 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCP110O43303 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCP110O43303 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCP110O43303 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCP110O43303 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCP110O43303 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCP110O43303 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCP110O43303 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCP110O43303 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCP110O43303 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCP110O43303 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCP110O43303 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCP110O43303 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCP110O43303 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCP110O43303 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCP110O43303 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCP110O43303 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCP110O43303 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms