Protein–RNA interactions for Protein: O00625

PIR, Pirin, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIRO00625 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PIRO00625 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PIRO00625 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIRO00625 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIRO00625 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIRO00625 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIRO00625 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIRO00625 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIRO00625 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIRO00625 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIRO00625 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIRO00625 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIRO00625 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIRO00625 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
PIRO00625 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIRO00625 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIRO00625 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIRO00625 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIRO00625 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIRO00625 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIRO00625 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIRO00625 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIRO00625 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIRO00625 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIRO00625 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIRO00625 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PIRO00625 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIRO00625 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIRO00625 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIRO00625 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PIRO00625 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIRO00625 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIRO00625 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PIRO00625 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIRO00625 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIRO00625 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PIRO00625 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIRO00625 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIRO00625 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PIRO00625 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PIRO00625 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PIRO00625 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PIRO00625 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIRO00625 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIRO00625 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PIRO00625 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIRO00625 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PIRO00625 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIRO00625 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIRO00625 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PIRO00625 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PIRO00625 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PIRO00625 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PIRO00625 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PIRO00625 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIRO00625 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIRO00625 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIRO00625 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIRO00625 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIRO00625 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PIRO00625 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIRO00625 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIRO00625 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIRO00625 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIRO00625 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIRO00625 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIRO00625 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PIRO00625 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PIRO00625 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PIRO00625 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PIRO00625 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PIRO00625 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIRO00625 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIRO00625 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIRO00625 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIRO00625 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIRO00625 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIRO00625 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIRO00625 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIRO00625 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIRO00625 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIRO00625 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIRO00625 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIRO00625 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIRO00625 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIRO00625 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIRO00625 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIRO00625 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIRO00625 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIRO00625 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIRO00625 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIRO00625 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIRO00625 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIRO00625 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIRO00625 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIRO00625 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIRO00625 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIRO00625 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIRO00625 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PIRO00625 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms