Protein–RNA interactions for Protein: E9PJ23

NPIPB6, Nuclear pore complex-interacting protein family member B6, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB6E9PJ23 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NPIPB6E9PJ23 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NPIPB6E9PJ23 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NPIPB6E9PJ23 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NPIPB6E9PJ23 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NPIPB6E9PJ23 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NPIPB6E9PJ23 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NPIPB6E9PJ23 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NPIPB6E9PJ23 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NPIPB6E9PJ23 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
NPIPB6E9PJ23 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NPIPB6E9PJ23 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NPIPB6E9PJ23 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NPIPB6E9PJ23 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NPIPB6E9PJ23 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NPIPB6E9PJ23 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NPIPB6E9PJ23 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NPIPB6E9PJ23 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NPIPB6E9PJ23 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NPIPB6E9PJ23 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NPIPB6E9PJ23 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NPIPB6E9PJ23 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NPIPB6E9PJ23 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NPIPB6E9PJ23 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NPIPB6E9PJ23 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NPIPB6E9PJ23 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NPIPB6E9PJ23 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NPIPB6E9PJ23 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NPIPB6E9PJ23 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NPIPB6E9PJ23 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NPIPB6E9PJ23 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NPIPB6E9PJ23 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NPIPB6E9PJ23 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NPIPB6E9PJ23 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NPIPB6E9PJ23 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPIPB6E9PJ23 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPIPB6E9PJ23 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPIPB6E9PJ23 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPIPB6E9PJ23 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPIPB6E9PJ23 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPIPB6E9PJ23 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPIPB6E9PJ23 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPIPB6E9PJ23 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPIPB6E9PJ23 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPIPB6E9PJ23 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPIPB6E9PJ23 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPIPB6E9PJ23 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPIPB6E9PJ23 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NPIPB6E9PJ23 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPIPB6E9PJ23 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPIPB6E9PJ23 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPIPB6E9PJ23 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms