Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PCYOX1L-207ENST00000514349 2793 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 EXD2-203ENST00000409018 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ELN-201ENST00000252034 3781 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RUBCNL-208ENST00000429979 3979 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RASAL2-201ENST00000367649 4378 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC38A1-201ENST00000398637 8066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP8A1-202ENST00000381668 8270 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR47-202ENST00000361054 4115 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 DIAPH2-203ENST00000373049 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB14-207ENST00000614697 3341 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AKAP2-201ENST00000259318 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF195-203ENST00000343338 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF700-203ENST00000622593 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAM3A-202ENST00000460383 2528 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TNFRSF11B-201ENST00000297350 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SHANK2-201ENST00000338508 7271 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RIPK3-201ENST00000216274 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE6A-204ENST00000613228 5398 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RACK1-227ENST00000512805 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RGS22-218ENST00000617334 4253 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PI4KB-204ENST00000368875 3983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms